Starodávné mesto Antikov, ktoré vystupuje v legendách mnohých národov Zeme. Atlantis bola pôvodne umiestnená na Tauri - bolo to posledné mesto, ktoré tu Antikové postavili. Neskôr, keď sa Antikové rozhodli kolonizovať galaxiu Paegas, presunulo sa mesto tam.
Tento presun umožnila jedinečná konštrukcia mestá, ktorá nemá ani u antických technologických výtvorov obdobu. Mesto totiž funguje zároveň ako mezihvězdné plavidlo. V spodnej časti centrálneho podstavca sú umiestnené motory pre cestovanie hyperpohonom. Rýchlosť ktorú je schopné mesto dosiahnuť však nie je známa - v archívoch Antikov tento údaj zatiaľ nebol nájdený a Tauriové nikdy s mestom nevzlétli - jednak nemali dostatok energie, a jednak k tomu nebol nikdy dôvod.
Atlantis je primárne napájaná troma Z.P.M. Na plný chod mesta stačia dva moduly, jeden je záložný pre posilnenie štítov v prípade útoku, alebo na aktiváciu a napájanie hypermotorů pre mezihvězdné cesty. Potom čo sa Atlantis vynorila, bola na jej oživenie spotrebovaná všetky zvyšné energie. Tauriové potom dokázali napojiť na energetické systémy mestá svoje naquadahové generátory. Stačily síce na zabezpečenie chodu mesta a jeho udržanie na hladine, nemali ale dostatočnú kapacitu aby mohli napájať pasívne ani aktívne obranné systémy.
Najdôležitejšie obranu Atlantis zabezpečuje antický energetický štít. Tento štít je dostatočne silný na to, aby odolal útoku akéhokoľvek rozsahu - doba po ktorú vydrží štít vztyčený záleží len na množstvo energie, ktoré majú jeho generátory k dispozícii. Na jeho aktiváciu je však potrebné aby mesto bolo napájané aspoň jedným ZPM. Štít sa ako väčšina ďalších systémov obsluhujú z kontrolnej miestnosti.
Atlantis je tiež vybavené aktívnymi obrannými systémy - sú to zbraňové centra známa z obranných základní v antických kolóniách. Aj v prípade atlantis sú tieto systémy riadené z kontrolného kresla.
Vzhľadom k veľkosti mesta by bola pešej chôdze v mnohých prípadoch dosť nepraktické - preto je Atlantis vybavená systémom transportérov, ktorý zahŕňa všetky jej časti.
Najdôležitejším bodom celého mesta je jeho stredná časť s hlavnou vežou. Tu je umiestnené kontrolné centrum, miestnosť s bránou, v spodnej časti veže sú hangáre pre puddle jumpery a v jej vrchnej časti je potom otvor, kadiaľ môžu tieto lode vylet. Okrem toho je tu umiestnený tunel, vedúci z hangáru priamo do miestnosti s bránou. To umožňuje aby lode samotnej bránou prechádzali. Hlavný energetický distribučný systém je taktiež umiestnený v spodnej časti hlavnej veže, hneď nad hyperpohonovými motormy. Šesť okrajových častí mesta obsahuje všetko, čo Antikové považovali za potrebné - sú tu laboratóriá, skladisko, hostely, ošetrovne, cely a množstvo ďalších miestností, o ktorých nikto netuší k čomu vlastne slúži.
Keď Antikové Atlantis opustili, potopili ju na dno oceánu aby nepadla do rúk Wraithom a tí si tak mysleli, že s ňou odleteli späť do našej galaxie. Jediné čo ju po desiatky tisíc rokov držalo pohromade bol vztyčený štít - ten zabraňovala prenikaniu morskej vody do mesta. Počas rokov sa však postupne všetky tri zdroje energie vyčerpané a keď prišli Tauriové a mesto ožilo, štít sa zrútil a Atlantis zaplavila voda. Medzi tým sa však Elizabeta omylom vrátila do minulosti do doby, kedy Antikové Atlantis opustilo. Podarilo sa jej jedného z nich presvedčiť, aby naprogramoval bezpečnostný mechanizmus, vďaka ktorému sa Atlantis vynorí v prípade zlyhania štítu. To sa aj stalo a Atlantis tak prežili príchod Tauriov.
Tauriom sa neskôr náhodou podarilo objaviť na jednej zo svojich výprav sesterské mesto Atlantis. Toto mesto bolo tisíce rokov pochované pod krajinou-az veľkej časti zničený, pravdepodobne útokom wraith. Uchovala sa však jeho centrálna časť s kontrolnou vežou. V sesterské meste našli Tauriovia hangár plný puddle jumper a tiež niekoľko stoviek dronov - tieto veci potom získali od obyvateľov planéty výmenou za jedlo a lekársku pomoc.